菏澤市的舊房維修基金收費是分三個階段進行的，具體如下：
第一階段，舊房交易時收取基金
在菏澤市，舊房在交易時，需要向房屋維修基金賬戶中繳納一定的維修基金，具體數額為房屋總價的2%。例如，一套售價100萬元的舊房，在交易時需要繳納2萬元的維修基金。
第二階段，每年按照房屋面積收取基金
除了在交易時繳納維修基金外，對于已經交納了維修基金的舊房，每年還需要按照房屋面積向維修基金賬戶中再次繳納一定的基金。具體標準是，每平方米每年繳納0.3元。例如，一套面積為100平方米的舊房，每年需要繳納30元的維修基金。
第三階段，出現維修問題時按比例繳納基金
在舊房出現維修問題時，房主需要向維修基金賬戶中再次繳納一定的基金。具體數額根據修繕費用的比例來定，標準為：“修繕費用小于等于2000元的，按照修繕費用的90%繳納；修繕費用大于2000元的，按照修繕費用的85%繳納。”
菏澤市的舊房維修基金收費是按照房屋總價、房屋面積和修繕費用的比例進行繳納的，旨在為房屋維修基金賬戶積累一定的資金，以保證舊房的日常維修和管理工作的順利進行。
（完）
